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内容简介:
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书籍目录:
绪论/1篇 基础实践/9
项目1基因组测序模拟/9
项目2序列组装/16
项目3基因组注释之同源基因搜索/26
项目4基因组注释之从头预测与基因结构建模/37
项目5基因组注释之DNA元件预测/45
项目6基因组数据可视化/59
篇扩展实践/64
项目1高通量测序平台及模拟工具的对比/64
项目2基因组序列组装软件的对比/67
项目3 RNA-Seq数据从头组装软件的对比/70
项目4从头计算预测基因软件的比较/73
项目5基于转录组数据的新基因和转录变异体的发现/76
项目6基因转录调控分析/79
项目7基因组测序可视化工具的对比/87
第三篇 综合实践/90
项目1基因组测序模拟的编程实现/90
项目2同源基因搜索指导的基因结构预测 /94
项目3基于RNA-Seq数据的基因组注释/100
项目4 基于多重数据源的基因结构特征训练和应用 / 107
项目5基因结构特征模型参数的编程实践/110
项目6多重证据联合的基因结构建模/114
项目7转录因子调控机制分析/117
其他综合实践设想/123
第四篇常用软件使用手册/124
1. ART / 124
2. Augustus / 136
3. BamTools / 152
4. BCFtools / 156
5. bedtools / 191
6. Bowtie2 / 213
7. FastQC / 235
8.GFF格式处理工具/249
9. NCBI BLAST / 260
10. NCBI SRA Toolkit / 276
11. QUAST / 286
12. Samtools / 298
13. SOAPdenovo / 325
14. Trimmomatic / 339
15. Trinity / 343
16.文件格式转换工具/353
附录/354
附录1基因组坐标体系/354
附录2常用数据格式/357
参考文献 /383
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书籍信息完全性:3分
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书籍清晰度:6分
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不错。。。。。
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非常好就是加载有点儿慢。
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书籍真实打分
故事情节:8分
人物塑造:5分
主题深度:9分
文字风格:5分
语言运用:6分
文笔流畅:9分
思想传递:5分
知识深度:4分
知识广度:3分
实用性:6分
章节划分:3分
结构布局:4分
新颖与独特:3分
情感共鸣:8分
引人入胜:6分
现实相关:9分
沉浸感:6分
事实准确性:9分
文化贡献:6分